UcallWeconn

Вялікамалекульных бібліятэка (mmLib) для Python


Original on http://pymmlib.sourceforge.net/

This translation is proudly done by UcallWeconn. UcallWeconn is not a cheapest international calls service, but still you can save a lot, when buying international numbers (DIDs) with further integration and possibility to make cheap long distance calls.

Рэзюмэ

Python вялікамалекульнря бібліятэка (mmLib) з'яўляецца інструментарам праграмнага забеспячэння і бібліятэк падпраграм для аналізу і апрацоўкі вялікамалекульных структурных мадэляў, рэалізаваныя на мове праграмавання Python. Ён даступны праз аб'ектна-арыентаваны інтэрфейс прыкладнага праграмавання, а таксама падае шэраг карысных праграмных кампанентаў для разбору mmCIF, і PDB файлы, бібліятэкі атамных элементаў і монамераў, аб'ектна-арыентаваныя структуры дадзеных апісанні біялагічных макрамалекул, і OpenGL малекулярнай гледача. Мадэль mmLib дадзеных прызначана для забеспячэння лёгкага доступу да розных узроўняў дэталізацыі, неабходных для ажыццяўлення на высокім узроўні прыкладных праграм для крышталяграфіі макрамалекул, ЯМР, мадэляванні і візуалізацыі. Гэта складаецца з спецыялізаваныя класаў для бялкоў, ДНК, амінакіслот, і нуклеінавых кіслот. Таксама маецца шырокая бібліятэка монамеру, элемент бібліятэкі, а таксама спецыялізаваных класаў для выканання элементарнага вочка разлікаў у спалучэнні з поўнай бібліятэкай групы.

Прыкладанні

Два прыкладанні распаўсюджваюцца з mmLib. Адным з іх з'яўляецца рэдактар GUI mmCIF які выкарыстоўвае інструментар GTK.

TLS малекулярная Viewer (tlsviewer.py)

OpenGL малекулярнага прагляду з дапамогай модуля mmLib.GLViewer рэндэрынгу і GTK-2.0 Toolkit. Асаблівасці складаюцца з (спасылкі на скрыншоты):

mmCIF GUI рэдактар файлаў
Рэдактар графічнага інтэрфейсу для файлаў mmCIF выкарыстаннем GTK-2.0 Toolkit. скрыншоты.

Публікацыі

Jay Painter і Ethan Merritt (2004) "mmLib Інструментар Python для працы з анатаванай структурных мадэляў біялагічных макрамалекул". J. Appl. Cryst. 37, 174-178 (Copyright © Міжнародны звяз крышталяграфіі). Перадрук (PDF дакумент)

Jay Painter і Ethan Merritt (2005) "mmLib малекулярнай прагляду для аналізу цвёрдага цела руху TLS у макрамалекулах." Acta Cryst. D61, 465-471 (Copyright © Міжнародны звяз крышталяграфіі). Перадрук (PDF дакумент)

Дакументацыя

Аўтары

  • Ethan Merritt: merritt _at_ u.washington.edu
  • Jay Painter: jay.painter _at_ gmail.com

Valid CSS Valid XHTML 1.0 Transitional

---